Pondok Pesantren Al-Hikmah memiliki jumlah santri sebanyak 668 orang yang tersebar menjadi santri Madrasah Aliyah (MA), Sekolah Menengah Kejuruan (SMK), dan Sekolah Menengah Pertama (SMP) Al-Hikmah. Santriwan dan santriwati Al-Hikmah memiliki keinginan kuat untuk mengenyam pendidikan, namun mereka memiliki keterbatasan perekonomian, sehingga pihak PP Al-Hikmah tidak memungut biaya baik untuk pemondokan ataupun sekolah formal.
Pondok pesantren yang bertempat di Sumberjo, Karangmojo, Gunung Kidul ini memperoleh dana operasional melalui donatur tetap, donatur tidak tetap, instansi pemerintah, syahriyyah wali santri, infaq, dan shadaqoh masyarakat. PP Al-Hikmah saat ini juga mempunyai permasalahan dalam pemenuhan hak atas pangan dan pengelolahan lahan.